Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INCENPQ9NQS7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms