Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFDN4Q9NQP4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PFDN4Q9NQP4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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