Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms