Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKRIP1Q9H875 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms