Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AL732372.1-203ENST00000635159 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms