Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12CQ9C0D7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms