Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFAP74Q9C0B2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms