Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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TM2D3Q9BRN9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TM2D3Q9BRN9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TM2D3Q9BRN9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TM2D3Q9BRN9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TM2D3Q9BRN9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TM2D3Q9BRN9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TM2D3Q9BRN9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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