Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3AQ99856 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms