Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5Q99717 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms