Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms