Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms