Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBL7Q96S82 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms