Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms