Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms