Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms