Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms