Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP36Q96EU6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP36Q96EU6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms