Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms