Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms