Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRQ92752 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRQ92752 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRQ92752 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNRQ92752 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNRQ92752 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNRQ92752 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNRQ92752 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNRQ92752 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNRQ92752 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNRQ92752 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNRQ92752 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNRQ92752 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNRQ92752 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TNRQ92752 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNRQ92752 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNRQ92752 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNRQ92752 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRQ92752 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms