Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms