Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHIPQ8WWQ0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms