Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO7Q8WWI1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms