Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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TRAPPC6BQ86SZ2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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