Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms