Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3FQ6ZSY5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160 ms