Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms