Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM72Q6ZMU5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms