Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms