Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms