Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms