Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms