Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms