Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SUSD4Q5VX71 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms