Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms