Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RIF1Q5UIP0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms