Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNDC3AQ59EK9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNDC3AQ59EK9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms