Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms