Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms