Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms