Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX7Q2KHR2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX7Q2KHR2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms