Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q1T7F1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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