Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCSK7Q16549 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCSK7Q16549 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCSK7Q16549 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCSK7Q16549 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCSK7Q16549 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms