Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms