Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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