Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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