Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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