Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms