Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
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